Este espacio fue uno de los primeros en incorporarse al Instituto Nacional de Antropología e Historia (INAH), en 1940, aunque como Museo de Arte Religioso ya operaba desde 1935.

El recinto es uno de los mayores exponentes de la vida monacal femenina en el país y único en el estado de Puebla, ya que cuenta con un acervo de arte sacro de los siglos XVI-XIX, conformado en su mayoría por cuatro colecciones de antiguos conventos femeninos de la ciudad: Santa Mónica (Agustinas Recoletas), Santa Catalina (Dominicas), del Señor San Joaquín y Santa Ana (Capuchinas) y La Soledad (Carmelitas Descalzas). Correspondiente al siglo XX, cuenta con obra firmada por importantes autores de la época, tales como Juan de Villalobos, Miguel Cabrera, Francisco Castillo, Lorenzo Zendejas, Rafael Morante, entre otros más.

Este museo cuenta con dos patios, el de Profesas y el de Novicias, además de 23 salas de exposición permanente, las cuales se dividen salas temáticas y salas de sitio.
En la planta baja se encuentran:

Sala Introductoria

La Virreinal Puebla de los Ángeles

Vida Cotidiana

Placeres (sala de sitio)

Cocina y Despensa

Refectorio

Sala Capitular

Biblioteca

Antecoro Bajo

Coro Bajo

En la planta alta, las salas son:

Coro Alto

Antecoro Alto

Vida de San Agustín

Celda

Relicarios

Dechados

Pasajes hagiográficos

Alegorías y Patrocinios

Despacho de la Priora

Terciopelos de Rafael Morante

Sala Mariana

Monjas Coronada

Místicas

Se divide en museográfica (a base de dicroicos) y de servicio (a base de leds y fluorecentes compactas)

A base de drenes perimetrales en salas de planta baja.

Taquilla

Visitas guiadas

Guardabultos

Sanitarios

Rampas, elevador y sanitario para discapacitados

Oferta cultural programada

1 de enero de 1935

Se realiza mayormente a través de las redes sociales, aunque también se recurre a carteles e invitaciones impresas, así como por medio de boletines de difusión.