El CIIDIR Unidad Oaxaca cuenta con una biblioteca especializada, acorde a la naturaleza de sus programas académicos de posgrado. Cumple con las normas de la Asociación de Bibliotecarios de Instituciones de Enseñanza Superior y de Investigación. El acervo con el que cuenta es de tipo monográfico (libros, publicaciones seriadas y tesis) y a través de la Red Politécnica se puede tener acceso a la base de datos e información del acervo disponible en el Consorcio Nacional de Recursos de Información Científica y Tecnológica (CONRICyT), a la Biblioteca Nacional de Ciencia y Tecnología (BNCT) y a la red de bibliotecas locales de las escuelas y unidades del Instituto Politécnico Nacional.