Es considerada como una de las más completas del país en información bibliográfica y hemerográfica en Inmunología, Biología del desarrollo, Biología celular, Biología molecular, Genética, Fisiología, Toxicología, Biotecnología e Investigación biomédica básica, tiene la mejor y más completa colección de libros y revistas científicas, tanto en papel como electrónico.
Cuenta con un acervo de 24 209 volúmenes de libros en papel; 57 882 volúmenes encuadernados de revistas, 5 913 reimpresos de la producción científica del Instituto desde 1942 a la actualidad, 1 088 títulos de tesis y 130 títulos de libros electrónicos, 1 076 títulos de revistas impresas; también se tiene acceso a más de 2 000 títulos de revistas electrónicas de texto completo relacionadas con biomedicina.

Esta biblioteca inició su desarrollo en el año de 1954, siendo director del Instituto el doctor Ignacio González Guzmán. En 1957 contaba con un acervo de 650 volúmenes clasificados con el Sistema Decimal.
En octubre de 2006, se planeó y se trasladó el acervo bibliográfico a un nuevo sitio, en el edificio “a” de la nueva sede del Instituto, ubicado en el Tercer circuito exterior de Ciudad Universitaria. febrero de 2007 se reanudó el servicio. El nuevo local cuenta con una área de 864 m 2 , distribuido el acervo en la siguiente forma: hacia el lado sur el acervo de li - bros y revistas, así como la colección de tesis hasta el año 2000, y en el lado norte el