Es una extensa colección de libros en las siguientes áreas del conocimiento: Estudios Literarios, Estudios Clásicos, Lingüística Hispánica, Estudios Mayas, Poética, Lenguas Indígenas, Ecdótica y Hermenéutica, que incluye a los más distinguidos autores del mundo, acorde con los programas de investigación y los planes y programas de estudio del Instituto. Están ordenados según la clasificación de la Biblioteca del Congreso de Estados Unidos, en estantería abierta.

Esta biblioteca fue creada en 1988. Se reunieron en ella, en un solo espacio arquitectónico, los recursos bibliográficos y hemerográficos disponibles en las bibliotecas de los cuatro centros y el seminario que entonces conformaban la dependencia
El 26 de noviembre de 1996, Se inauguró el nuevo edificio, de 2 100 metros cuadrados, diseñado por el despacho del arquitecto A. Recamier, que albergaría las crecientes colecciones de la recién nombrada Biblioteca Rubén Bonifaz Nuño.