El museo, abierto al público el 30 de junio de 1990, está localizado dentro de una obra comunitaria; en 2010, el espacio fue remodelado. Este recinto ofrece un panorama histórico de la comunidad, mediante documentos, fotografías y testimonios de personas del pueblo. Asimismo, se exhiben piezas arqueológicas de la cultura mixteca, un lienzo colonial en el que se señalan los límites y parajes de Santa María Yucuhiti y una muestra de las artesanías textiles que ahí se elaboran. Cabe resaltar que el museo tiene a su cargo la coordinación de exposiciones temporales, programas radiofónicos, festivales y concursos.

Cuenta con cinco salas de exhibición permanentes:

Salón de los Expresidentes (de 20 m²)

Esta sala está conformada por fotografías y biografías de exautoridades.

Artesanías (de 20 m²)

Muestra la riqueza artesanal

Tenencia de la Tierra (de 12 m²)

Hallazgos Arqueológicos

Exhibe piezas arqueológicas encontradas en el municipio.

Monografías de las Agencias de Santa María Yucuhiti

Exhibe la monografía de las ocho comunidades que pertenecen al municipio de Santa María Yucuhiti.

Cuenta con una sala de exhibición temporal:

Nuestra Lengua Tu ´un Ñuu Savi

30 de junio de 1990