En 1998, el arquitecto Carlos Lozano tuvo a su cargo, bajo la supervisión del arqueólogo Juan Yadeun Angulo, la edificación de un recinto que alojara y preservara el patrimonio de esta zona arqueológica. El 1 de julio de 2000, se inauguró el Museo de Sitio de Toniná.

Esta construcción se encuentra en un sitio transitorio entre la selva chiapaneca y el bosque. Su acervo se constituye por diversos vestigios de la historia de la cultura maya, tales como utensilios de uso cotidiano, esculturas de tipo militar, religioso y político, y piezas de las dinastías que gobernaron Toniná.

Es un inmueble de una sola planta con dos salas de exposición (salas A y B)
Difunde un panorama histórico de la cultura maya según sus mitos de origen, reunidos en el libro sagrado del Popol Vuh, con la intención de dejar constancia de la concepción histórica y mitológica expresada en los restos materiales de los mayas asentados en esta ciudad prehispánica.

La colección está conformada por objetos arqueológicos del sitio, como esculturas de piedra con representaciones de dioses y gobernantes o con inscripciones y grabados vinculados a su cosmovisión.

Destaca la reproducción del friso-mural de estuco donde se representa la noción maya de las cuatro edades de la humanidad. Igualmente se encuentra un grupo de discos-marcadores del tiempo, que representa la secuencia de la historia humana y divina de los mayas.

Estacionamiento
Guardarropa
Expendio de publicaciones
Auditorio

1 de julio de 2000