El Museo de Historia de Ocotlán comenzó sus operaciones el 15 de abril de 1975, en un espacio facilitado temporalmente al interior del Palacio Municipal. A partir de 1980 la nueva sede del Museo sería la finca numero 3 de la calle Hidalgo, lugar en donde hasta estas fechas se localiza tan importante centro cultural de la región. En 2011 el Museo de Historia de Ocotlán recibió el Galardón al Mérito Museístico por parte del Gobierno del Estado de Jalisco. En 1980, con la aprobación del cabildo municipal, fue trasladado a la entonces casa de la cultura, recinto al que posteriormente le fue creado un edificio más amplio y funcional.
Las colecciones que exhibe el museo son: la historia del municipio representada por herramientas agrícolas, embarcaciones a escala que navegaron el lago de Chapala y fotografías del antiguo Ocotlán; restos fósiles de animales prehistóricos y vegetales; artículos religiosos y bélicos de la Guerra de Independencia.
Cuenta con una importante colección de piezas zoomorfas y antropomorfas de cerámica prehispánica y fotografías, además de petroglifos abundantes en los cerros de la rivera norte del lago.
El museo ofrece funciones de cine infantil para los fines de semana y periodos vacacionales, así como visitas guiadas a grupos escolares y publico en general.
El museo fue remodelado el 18 de diciembre de 2008.

Cuenta con tres salas de exhibición permanente: Prehistoria, Arqueología e Historia

• Sala de la Prehistoria:
  En este espacio de exhiben piezas paleontológicas que datan de hace millones de años, como los amonites provenientes de las cosas del pacifico, o los fósiles de mamut y caballo encontrados en las orillas del Lago de Chapala.
  También se pueden apreciar objetos y herramientas humanas de las diferentes etapas líticas de Mesoamérica.
• Sala de Arqueología: Importante colección de objetos arqueológicos encontrados entre Jalisco y Michoacán, particularmente en la ribera de Chapala. Existen obras antropomorfas, zoomorfas, joyas y deidades prehispánicas, como las figuras de Tláloc, al que se le rendía culto en la región
• Sala de Historia regional: En este espacio podemos contemplar objetos e indumentaria de la época colonial hasta nuestros tiempos. Resaltando la narrativa de acontecimientos importantes que ocurrieron en Ocotlán durante la independencia, el porfiriano y la revolución.

Cuenta con una sala de exhibición temporal, que regularmente se actualiza cada trimestre.

• En este espacio se exhiben importantes exposiciones temáticas sobre cultura, arte y tradición, tanto de Ocotlán como de otras partes del interior del estado de Jalisco

15 de abril de 1975