Este museo se ubica en el Casco de la Ex Hacienda de la Tenería. Cuenta con una colección que se relaciona con las 19 zonas naturales protegidas de San Luis Potosí.

Cuenta con material o ambientaciones de lugares como Wirikuta, El Túnel Ogarrio, la Sierra de Álvarez, la Sierra Boscosa de Xilitla, la Media Luna, y del Sótano de las Golondrinas.

El Ecomuseo describe las infografías oficiales de las siete zonas naturales protegidas federales y las 12 estatales, donde se aplicó la metodología de los ecomuseos europeos, es decir, áreas naturales en convivencia con el hombre, asimismo, se describen la biodiversidad de las cuatro zonas del estado.

Dentro del museo se pueden observar grandes murales con la flora de cada zona del estado, variedad de peces y cactáceas. Tiene diversos audiovisuales con el recorrido huichol y el turismo de aventura. Hay salas temáticas, donde se crean efectos y sensaciones de estar en el Sótano de las Golondrinas. Por medio de audios, se recrea el sonido e imágenes de cuando entran y salen las golondrinas del lugar.