Residente en Santa Barbara, California, nació y se crió en la Ciudad de México donde estudió Bellas Artes, interés que siguió en el San Francisco Art Institute y el London College of Printing. Mientras asistía al London International Film School, dirigió su primer cortometraje, "Silent Music", el cual ganó el premio más importante en el International Amateur Film Festival del Festival de Cine de Cannes de 1976.
Regresó a México para dirigir numerosos cortometrajes y documentales para el Instituto Nacional Indigenista, Conacine y el Centro de Producción de Cortometrajes. En 1980, Mandoki ganó el Premio Ariel (los Oscar mexicanos) por su cortometraje, "The Secret". Su primer largometraje, "Motel", fue elegido para representar a su país en cinco festivales de cine.
Después, llegó el desarraigo. Su primera película americana fue "White Palace", protagonizada por Susan Sarandon y James Spader, a la que siguió la comedia "Born Yesterday", con Melanie Griffith, y "When a Man Loves a Woman" protagonizada por Andy Garcia y Meg Ryan. En 1999 dirigió "Mensaje en una Botella", protagonizada por Kevin Costner y Paul Newman. Después vendrían "Angel eyes", en 2001, protagonizada por Jennifer López, "Atrapada", con Charlize Theron, Kevin Bacon y Courtney Love, y "Voces inocentes" (2004), que narra una historia melodramática retratando la brutalidad de la guerra civil salvadoreña y las heridas que ésta deja en la niñez.
"Gaby. A True Story", la que escribió, produjo y dirigió, recibió dos nominaciones a los Globos de Oro y una nominación al Oscar por Mejor Actriz Secundaria para Norma Aleandro.

Filmografía:
2006 (2007)Fraude: México
2006 ¿Quién es el señor López?
2004 Voces Inocentes
2003 The Edge
2002 Trapped
2001 Angel Eyes
2000 Amazing Grace
1999 Message in a Bottle
1994 Cuando Un Hombre Ama A Una Mujer
1993 Born Yesterday
1990 White Palace
1989 The Edge (TV)
1987 Gaby: a true story
1984 Motel
1982 Papaloapan
1980 El secreto
1980 Campeche, un estado de ánimo
1980 Mundo mágico

Premios:
Festival de Cannes en 1976: por Silent Music
Premio Ariel en 1980: Mejor director por El secreto
Golden Globe: Gaby:una historia verdadera, dos nominaciones
Óscar: Gaby: una historia verdadera, nominación
Festival de Berlín: Oso de Cristal por Voces Inocentes
Premio Stanley Kramer: por Voces Inocentes
Premio al Mejor Director del Año 2005, otorgado en 2006 por Canacine.